(Acidobacteria) Тип Ацидобактерии, Phylum Acidobacteria 1 класс


Информация из Интернета  

         Ацидобактерии (Acidobacteria) — тип (фила) царства бактерий. Представители филы широко распространены и имеют разнообразный метаболизм, особенно много их обнаруживается в почве. Однако лишь немногих представителей удалось культивировать.
         Первый представитель филы, Acidobacterium capsulatum, был описан в 1991 году. Однако как самостоятельная фила Acidobacteria были выделены лишь в 2012 году.
         Представители филы физиологически разнообразны и могут встречаться в самых разнообразных местообитаниях: почве (в том числе почвах, загрязнённых металлами), горячих источниках, океанах, пещерах. Многие представители Acidobacteria — ацидофилы, и в их числе первый описанный представитель филы, Acidobacterium capsulatum. Недавно описанные виды филы Acidobacteria — Holophaga foetida, Geothrix fermentans, Acanthopleuribacter pedis и Bryobacter aggregatus чрезвычайно многочисленны в почвах, поэтому могут играть важную роль во многих экосистемах. Однако большинство представителей Acidobacteria практически не поддаются культивированию, поэтому их физиология и экология изучены плохо. ДНК двух неклассифицированных бактерий филы Acidobacteria были обнаружены в наборах для выделения ДНК, что могло исказить метагеномные данные и данные о составе микробиоты.
         Несмотря на то, что тип Acidobacteria изучен очень мало, он важная составная часть многих экосистем, особенно почв. Часто, более чем 30% или даже 50% последовательностей микроорганизмов в образцах почвы, согласно анализу их 16S рРНК, принадлежали к этому типу. Они доминировали в молекулярных анализах влажных почв Висконсина, безводных почв Аризоны и в ризосфере масляных культурных растений. Отдельные последовательности представителей Acidobacteria также были обнаружены в пресноводных средах, микробных матах горячих источников, густой грязи сточных вод, биореакторах очистки сточных вод и других средах.
         По состоянию на 2010 год тип Acidobacteria содержал только три описанных вида: Acidobacterium capsulatum, Geothrix fermentans и Holophaga foetida, и несколько недавно идентифицированных изолятов. Физиологические данные об этой группе очень ограничены. Тип ацидобактерии пока только известный одним геном и его соответствующей последовательностью в общественных базах данных (эндо-1-4-бета-ксиланазы бактерии Acidobacterium capsulatum). Основываясь на филогенетическом анализе 16S рРНК, Acidobacteria может быть разделенными на шесть главных групп, которые отличаются до 22% своими генами 16S рРНК. Распространенность и большое количество этих микроорганизмов поднимает вопрос их экологической роли и метаболических процессов, в которых они участвуют, особенно в грунтовых средах. Основываясь на разнообразии их филогенеза и экологическом распространении, ожидается, что Acidobacteria метаболически и генетически представляют собой очень разнообразную группу, сравнимую с такими группами, как протеобактерий или грамм-положительные бактерии.
         Современная классификация ацидобактерий базируется на данных List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Филогенетическое дерево было построено на основе последовательностей 16S рРНК, предоставленных проектом «The All-Species Living Tree Project».