(Deinococcus-Thermus) Тип Дейнококкус-Термус, Phylum Deinococcus-Thermus 1 класс
Информация из Интернета
Дейнококкус-Термус (Deinococcus-Thermus) — малочисленная фила бактерий, состоящие из кокков чрезвычайно устойчивых к экологическим рискам. Единственный класс этой филы, Deinococci, включает два порядка: Deinococcales, куда входит один из самых радиорезистентных организмов в мире Deinococcus radiodurans, и Thermales, куда входит Thermus aquaticus, известный своей Taq-полимеразой, использующейся в ПЦР, и другими термостабильными ферментами.
Своё название фила получила по типовым родам Deinococcus и Thermus. Кавалир-Смит называет эту филу Hadobacteria Cavalier-Smith 2002 (от греческих слов αδης (gades, ades) — «ад», «преисподняя» и βακτηριον (baktirion) — «палочка», «бактерия»), указывая на устойчивость этих бактерий к действию высоких температур.
Порядок Deinococcales включает род, Deinococcus, с несколькими видами, чрезвычайно устойчивыми к радиации. Они стали известными благодаря способности питаться отходами ядерной промышленности и другими ядовитыми материалами, выживать в вакууме космического пространства и в экстремальных значениях температуры окружающей среды. Порядок Thermales включает несколько терморезистентных родов. Вид Thermus aquaticus был важен для развития цепной полимеразной реакции (PCR), где повторные циклы нагревания ДНК почти до кипения делают выгодным использование термостойкого фермента ДНК-полимеразы.
Все представители филы Deinococcus-Thermus имеют толстую клеточную стенку, характерную для всех грамотрицательных бактерий (хотя и представители рода Deinococcus и окрашиваются положительно по методу Грама). У представителей порядка Deinococcales во внешней мембране отсутствуют липополисахариды; они накапливают каротиноиды, придающие клеткам красный цвет. Геном представлен двумя многокопийными хромосомами. Представители Thermales в оболочке имеют S-слой и также накапливают каротиноиды, из-за чего их клетки часто имеют красный или жёлтый цвет.
Представители филы Deinococcus-Thermus являются аэробами и хемоорганогетеротрофами, встречаются повсеместно (представители порядка Thermales встречаются в горячих источниках). Филогенетический анализ показал, что фила Deinococcus-Thermus является одной из самых архаичных групп бактерий.
Основанием для создания таксона послужила близость последовательностей генов 16S рРНК, более того, сравнение геномов Deinococcus radiodurans и Thermus aquaticus также показывает определённый уровень гомологии. По-видимому, обе группы бактерий в ходе эволюции шли по одному пути к приобретению устойчивости к действию высоких температур. Стоит, однако, отметить, что, в отличие от Deinococcus, представители рода Thermus не отличаются повышенной устойчивостью к радиации. Вероятнее всего, термофильность Thermales обусловлена особыми формами ДНК-зависимой РНК-полимеразы и ДНК-топоизомеразы I, а в радиорезистенстность Deinococcus вносят вклад особые формы эксцинуклеазы ABC, ДНК-гиразы и белка RadA, задействованного в репарации ДНК.