Домен Эукариоты (Eukaryota Chatton, 1925), надцарство Эукариоты   5 царств
    Царство Хромисты (Chromista Cavalier-Smith, 1981), Regnum Chromista  8 типов   
        Тип Криптофитовые водоросли (Cryptophyta), Phylum Cryptophyta   1 класс   

            (Cryptophyceae) Класс, Class Cryptophyceae   4 отряда   


Представитель Отряда Cryptomonadales   (Cryptomonadales) Отряд, Order Cryptomonadales   6 семейств   
Представитель Отряда Goniomonadales   (Goniomonadales) Отряд, Order Goniomonadales   1 семейство   
Представитель Отряда Pyrenomonadales   (Pyrenomonadales) Отряд, Order Pyrenomonadales   3 семейства   
Представитель Отряда Tetragonidiales   (Tetragonidiales) Отряд, Order Tetragonidiales   1 семейство